植物分類學為植物學研究的基礎科目之一，內容介紹植物的多樣性、物種分化的起源和演化等主題。本課程主要介紹的類群為維管束植物，包含鑑定，命名，分類，物種演化，親緣關係等。除了臺灣植物之外，也會對於分布於世界各地區的重要植物進行介紹。
本課程的講授內容除植物分類學的相關主題外，尚包含臺灣自然史，特別是植物和植被史的基本介紹。此外在學期中也安排獨立主題之專題課程或演講，穿插於學期之中。全學期總共會介紹超過160個科，近千種的植物，但學習的重點在於對於科層級分類群的掌握，學期末學生應對其中常見而重要的五十個植物科有基本的瞭解。而臺灣的植物則希望學生能至少在常見類群中屬的層級有一定的認識。修習本課程之學生也強烈建議同時修習實習課(星期五678)，以增加實作學習的經驗。